这个世界流行离开，但我们却不擅长告别
发简信
IP属地：广东
-
-
单细胞个性化分析之转录因子篇转录因子(Transcription Factors，TFs)，是指能够以特定序列与基因专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。转录因子通...
-
-
Nature Communications:刻画多维免疫特征可预测免疫治疗的疗效
前言 作为肿瘤治疗跨时代的疗法之一，免疫检查点抑制剂（ICB）为很多癌症患者带来了生存希望，但是较低的应答率，较高的耐药率和昂贵的药价极大的限制了ICB的推广，促使科研研究者...
-
内皮间质转化EndMT1. 简介 EndMT是指在多种刺激因素作用下，内皮细胞失去其原有特征并向间充质细胞进行转化（肌成纤维细胞、平滑肌细胞等）的过程，其结果是ECs在极性、形态和功能等方面发生重...
-
ProjecTILs：一站式解决肿瘤和感染模型中T细胞的注释说在前面 Immugent最近淘到了一个特别好用的，针对T细胞亚群进行注释的辅助工具：ProjecTILs，这个软件好用到你只需要把要分析的表达矩阵给它，它就能帮你自动匹配之...
-
期待实操😍谢谢楼主
Scissor:整合bulk+scRNA鉴定功能亚群
前言 关注生信宝库时间比较久的小伙伴会发现，我们除了更新免疫相关的推文外，最多的就是单细胞研究相关的算法的文献解读了。最近有一位粉丝通过后台和我们说能不能更新一些单细胞联合b...
-
Scissor:整合bulk+scRNA鉴定功能亚群前言 关注生信宝库时间比较久的小伙伴会发现，我们除了更新免疫相关的推文外，最多的就是单细胞研究相关的算法的文献解读了。最近有一位粉丝通过后台和我们说能不能更新一些单细胞联合b...
-
copyKAT推断单细胞转录组肿瘤细胞CNV（自动识别肿瘤normal和tumor）hi，各位，2021年1月份发表了一篇文献Delineating copy number and clonal substructure in human tumors fr...
-
SciBet:一个软件解决单细胞注释所有烦恼说在前面 对于单细胞数据分析流程来说，其中最重要的一步就是对各种细胞亚群进行准确的注释，因为后续的分析全部在这个基础上进行，一步出错步步错；而且注释出的细胞类型还会影响后续进...
-
肿瘤微环境中免疫细胞的双重作用：促肿瘤和抗肿瘤及其触发因素免疫系统与肿瘤之间的关系是目前癌症领域研究最多的课题之一。以前，人们认为癌症仅肿瘤本身的作用；然而，现在我们知道它需要不同细胞和细胞因子的支持，即肿瘤微环境（TME）。在构成...
-
需要靠其他marker来决定吧
单细胞亚群鉴定知多少（三）
作者：尧小飞审稿：童蒙编辑：angelica 引言 随着单细胞数据的增多，单细胞亚群的鉴定越来越成为一个单细胞分析的一个关键的、限制性的过程。今天继续分享一下我们究竟如何去“...
-
-
ProjecTILs系列教程（四）：衰竭性CD8 T细胞亚群说在前面 Bassez等人在2021年的一项研究中，包含了29名乳腺癌患者在接受抗PD-1免疫治疗前和治疗后9 +/- 2天活检的单细胞数据。由于缺乏临床疗效的客观衡量标准，...
-
Apelin阳性内皮微环境细胞调控造血与血管再生
研究人员发现，在响应放疗和其他治疗后造血细胞本身的丢失，能够触发血管扩张、通透性和内皮细胞（EC）增殖。研究人员进一步确定了表达Apelin（Apln阳性）EC的小亚群，其占...
-
-
WGCNA（6）：筛选 hub gene通过前期的分析，我们确定了感兴趣的module，但是module中又含有几十甚至上百的基因，下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA（3）：基因模块与性状关联识别重...
