Introduction

空间组学近年来多次登上顶刊：

2021年Nature Methods探索癌症机制；

2022年Nature评为年度七大颠覆性技术；

2023年Cancer Cell在肿瘤微环境中的应用；

2023年Science评论空间组学是未来曙光；

……

一、什么是空间组学？

空间组学是继单细胞测序技术之后的又一个生物技术研究热点，其能够弥补单细胞测序技术无法获取细胞空间分布信息的缺陷。空间组学旨在3D环境中绘制细胞的分子生物学信息，用于揭示细胞空间分布关系对疾病的影响，目前主要检测的是蛋白质和RNA。

茵菲生物空间组学平台技术介绍：

二、空间组学与肿瘤免疫微环境

除了细胞类型和成分信息外，空间组学技术还包括细胞之间的空间位置信息，利用这些信息可以在组织中绘制多细胞结构图，或为研究单细胞表达和表型提供额外的信息。

为了推断不同层次的空间结构，分析方法可以分为自上而下或自下而上的两类。自上而下的方法基于先验知识侧重于特定的解剖结构，如肿瘤核心和边界，然后再去确认不同区域的独特特征，例如基因表达、细胞成分、相互作用等。在自下而上的方法中，组织内反复出现的近距离相互作用被识别出来，可以推测出高阶组织结构，这些方法用于评估细胞邻域间的相互作用。

肿瘤微环境的空间描述本身不仅有价值和信息量，而且还可以揭示导致这些组织模式形成的机制，并进一步阐述其功能和临床意义。未来的研究非常有必要将空间组学技术与仔细注释的患者队列、附加数据和控制良好的干扰相结合，将肿瘤微环境与进展、生存和治疗反应联系起来。在多数情况下，这些关联在空间信息整合方面优于仅从细胞类型频率中获得的关联，强调了肿瘤空间特征的重要性和临床意义。

三、空间组学在肿瘤中的应用

研究人员使用空间组学技术揭示了肿瘤免疫微环境的各种特征：

1、免疫细胞分布在肿瘤实质时，显示出更多的衰竭标记；

2、侵袭前沿活跃的肿瘤-免疫相互作用与更好的预后相关；

3、肿瘤相关基质细胞和成纤维细胞的行为在空间上相关；

4、肿瘤内细胞拓扑结构（如三级淋巴结构）扩展识别新的肿瘤生物标志物与患者预后相关；

……

四、空间组学技术面临的挑战

空间组学使得我们能够全面探索癌症，并进一步了解肿瘤进展的潜在机制，这对治疗和临床反应至关重要，但空间仍然面临着诸多的挑战，主要是成本、时间与分析上的挑战。

以时间为例，时间可分为进行实验前需要投入的时间、实验中的人工时间、仪器时间和分析时间；

在基于抗体的多重成像方法中，将一组抗体组合成一个稳健的panel也非常耗时；

分析的挑战：从大数据到有用数据。

但是！！！

茵菲生物可以提供稳定可靠的商业化一站式空间组学技术（IMC、CODEX、mIHC、空转），并且还可提供scRNA&空间组学的联合分析方案！

茵菲生物有专业的实验员、反复测试的对应不同组织的成熟的实验protocols（200+抗体已完测试，Loading……）、多年相关仪器使用经验、自主的博士生信分析团队、近百项大三甲医院重点科室合作项目经验……

新一代病理技术，茵菲cover住了！

【参考文献】

【1】Elhanani O, Ben-Uri R, Keren L. Spatial profiling technologies illuminate the tumor microenvironment. Cancer Cell. 2023.

【2】Bressan D, Battistoni G, Hannon GJ. The dawn of spatial omics. Science. 2023.

【3】Hsieh WC, Budiarto BR, Wang YF, et al. Spatial multi-omics analyses of the tumor immune microenvironment. J Biomed Sci. 2022.

【4】Eisenstein, M., Seven technologies to watch in 2022. Nature, 2022.

【5】Lewis SM, Asselin-Labat ML, Nguyen Q, et al. Spatial omics and multiplexed imaging to explore cancer biology. Nat Methods. 2021.