由于众多企业在应用 MES 信息技术方面难以达到预期目标，一些企业开始与研究机构合作进行这类问题的研究。其中最著名的研究成果就是MIT自1984年开始，直至1991终告结束的一项称之为“90年代的管理”的研究报告，该项研究调查了IT应用对各类机构的影响，研究人员发现：应用没有成效的企业大多是用计算机信息系统模拟手工业务处理流程，而成功的企业在应用IT的方式上则考虑到计算机化管理的特点，并对手工业务处理流程做了很多改变。该项研究将企业应用IT的水平划分为以下五个级别。
第1级：本地化应用。MES信息系统相互独立地应用在一个企业的各个部门，如财务部门、销售部门、库存管理部门等，以实现单项业务管理的计算机化和提高工作效率。
第2级：集成化应用。当一个企业应用信息技术进入成熟期时，他们会认识到需要将各个独立运行的系统联接到一起，如通过共享数据将财务与生产系统集成一体化。
第3级：MES业务流程重新设计。在应用信息系统前对企业手工业务处理流程进行重新改造或调整，以适合计算机信息处理的特点与计算机化工作方式的要求，而不是简单地模拟手工业务处理规程。
第4级：业务网络重新设计。重新设计企业与企业之间的业务处理过程，即对企业的整个供应链的工作流程进行重新设计。
第5级：业务范围重新定义。通过MES信息技术应用重新审视和调整业务范围。
从第1级到第2级是一个自然发展的渐进过程，一般发生在开始应用信息技术的一段时间之后。遗憾的是，这一阶段的收益也无疑是一个缓慢过程，企业一般没有充分发挥MES信息技术手段的潜能。第3、4、5级则是革命性的变化，这些级不是从现有的工作方式开始应用信息技术，而是注重对人们已习惯的原有工作方式与工作流程进行重新改造与设计，然后发挥信息技术手段支持新的工作方式的能力。第4级是在更大范围内进行业务流程重组，而第5级则是在更深层次（业务战略）上进行公司重组。
