注:可以用于其他格式文件,只要把所有的vcf改为其他相应的格式
1.清空R中环境变量
2.设置路径(.vcf格式文件所在文件夹)
setwd("/Users/bcl/Desktop/structure/variant")
3.生成.vcf文件的列表
myvcffile=list.files(pattern="*.vcf")
4.将列表中文件读入环境空间并以文件名作为变量名
list2env(lapply(setNames(myvcffile,make.names(gsub("*.vcf$","", myvcffile))),read.table,header=TRUE,check.names=FALSE),envir =.GlobalEnv)
5.查看环境变量,移除无用的环境变量
ls() //查看当前环境变量
rm("myvcffile") //移除环境变量
ls() //查看移除后的环境变量
6.把环境变量赋给一个变量并查看
y<-ls()
y