“基因组学或转录组学告诉你可能发生什么,蛋白质组学告诉你正在发生什么,而代谢组学则告诉你已经发生了什么!”-----Bill Lasley, UC Davis
《Metabolomics as a tool toidentify biomarkers to predict and improve outcomes in reproductive medicine: asystematic review》
代谢概念:包含生物合成和生物分解两大过程。
代谢物:通过代谢过程产生或消耗的物质,生物大分子不包括在内,生物大分子的前体及降解产物是代谢物。
代谢组学的特点:1.相对于其他组学研究,检测技术相对简单(液-质联用,气-质联用及核磁)2.代谢组学是体内外多种综合因素的最终结果。
代谢组学的应用:生物标志物寻找,治疗疗效的监控,疾病分型,中药研究中的治病机理,毒副作用评价。
代谢组学常用数据库:HMDB (http://www.hmdb.ca), KEGG, SMPDB (http://www.smpdb.ca/)等。
代谢组学研究思路:
1. 通过差异分析得到差异代谢物后,对大样本数据进行KM,ROC,Cox等分析,发现临床生存及疾病预测价值。
2. 差异代谢物进行功能研究,抗代谢物或者是添加外源代谢物,细胞及动物实验验证该代谢物对表型的重要性。
3. 多组学研究,根据代谢物找到上游调控蛋白,对上游蛋白进行研究。
文章推荐:《Functional Metabolomics Characterizes a Key Role for N-Acetylneuraminic Acid in Coronary Artery Diseases》IF=23
该文章确定代谢物N-Acetylneuraminic Acid在冠状动脉疾病进展中的作用机制。
《PML-Regulated Mitochondrial Metabolism Enhances Chemosensitivity in Human Ovarian Cancers》IF=22.4
本文章运用多组学联合分析的方法。
总结:从代谢物角度研究疾病发展,目前仍然是较新的研究思路。而且代谢物作为临床检测的指标也具有稳定性高,易于检测的优势。