mRNA：信使RNA（message RNA）,基因转录产生的RNA，也称为转录本。由于剪接等因素，一个基因转录常常可以形成多个mRNA。
CDS：编码区（coding sequence），指mRNA中编码蛋白质的那段序列。CDS是已知的一个基因上确确实实翻译成蛋白质的区段，成熟mRNA中由一个或几个exon组成。
exon, intro： 基因DNA分为编码区和非编码区，编码区包含外显子和内含子，一般非编码区具有基因表达的调控功能，如启动子在非编码区。编码区则转录为mRNA并最终翻译成蛋白质。
ORF：ORF则是指，任意一段序列，只要起于ATG止于终止子，都可以叫做ORF。ORF是一种预测，而不是一种已知的翻译区。即随意写下一段DNA序列，只要以三个碱基为单位能找到ATG和终止子，就可以称作ORF，这段ORF甚至可能不是一段真正存在的DNA序列，但是它仍然是ORF。一段序列是可以有多个ORF的，只有当ORF符合已知的可翻译成蛋白的序列时，才能等同于CDS。
一个mRNA可能有多个CDS,一个CDS也可能有多个exon。
