转录组数据处理技巧
1.相同gene symbol合并。
merged <- POS_liver %>%
group_by(`MS2 name`) %>%
summarize(.names = "{.col}") %>%
as.data.frame()
2.数据预处理。
mrna3_liver=mrna2_liver[rowMeans(mrna2_liver)>1,]
3.数据预处理。
# 假设 data 是你的数据框
# 计算每行数据中的缺失值数量
missing_values_per_row <- rowSums(is.na(data))
# 计算每行数据的总列数
total_columns <- ncol(data)
# 计算每行数据中缺失值的比例
missing_ratio_per_row <- missing_values_per_row / total_columns
# 筛选出缺失值比例小于等于10%的行
cleaned_data <- data[missing_ratio_per_row <= 0.1, ]
# 输出处理后的数据框行数
print(nrow(cleaned_data))
