简介
SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，包括NCBI序列阅读档案（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库。 日本（DDBJ）。 提交给三个组织中任何一个的数据在它们之间共享。
特点
存档来自各种高通量测序平台的原始测序数据和比对信息，比如Illumina。
二代测序流程
数据
SRA接受来自各种测序项目的数据，包括涉及人类受试者或其宏基因组的临床重要研究，其可能包含人类序列。
根据SRA数据产生的特点，将SRA数据分为四类：
Studies-- 研究课题
Experiments-- 实验设计
Runs-- 测序结果集
Samples-- 样品信息
SRA中数据结构的层次关系为：Studies->Experiments->Samples->Runs.
Studies是就实验目标而言的，一个study 可能包含多个Experiment。
Experiments包含了Sample、DNA source、测序平台、数据处理等信息。
一个Experiment可能包含一个或多个runs。
Runs 表示测序仪运行所产生的reads。
SRA数据库用不同的前缀加以区分：
ERP或SRP表示Studies；
SRS 表示 Samples；
SRX 表示 Experiments；
SRR 表示 Runs；
如何寻找并了解SRP
1.在文章中寻找GSE号（以GSE111229为例）
2.打开GEO数据库，输入GSE号
3.可通过Linux下载
4.打开NCBI，搜索SRP号
5.得研究基本信息
参考来源：生信技能树
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