PMID:33816274
杂志:Frontiers in Oncology
背景
作者通过对正常/癌旁与肿瘤组织进行GSEA分析发现5个糖酵解相关通路(glycolysis)在肾透明细胞癌(ccRCC)中都有显著差异,因此作者想研究下糖酵解相关基因对ccRCC的影响。
结果
1.GSEA+差异分析
- 作者选取5个糖酵解相关通路,以FDR < 0.25 作为阈值,表明ccRCC确实与糖酵解有关。
- 288糖酵解相关基因→差异分析→unicox+PPI
2.模型构建
3.模型验证
-
收集78例ccRCC病例验证
-
GSE22541验证
4.模型周边-药物敏感性和免疫反应性
作者用 E-MTAB-3267(53例)和 E-MTAB-3218(59例)直接验证模型对药物敏感和免疫治疗的反应性,这点非常值得借鉴。
感悟
通过真实检测队列查看模型对药物敏感性和免疫治疗的反应性,值得借鉴。