随着测序技术的发展及新的组装工具的不断开发应用，基因组denovo测序及组装进入了Genomic2.0时代，我认为Genomic2.0时代的标志...
投稿
收录了51篇文章 · 4人关注
-
单倍体组装工具Hifiasm简介及基本运行命令(一) -
EVidenceModeler(EVM)流程做基因组注释简单小例子
首先是安装这个流程，试了一下可以使用conda进行安装 安装好以后很多perl脚本是在 anaconda3/envs/EVM/opt/evide...
-
新版EvidenceModeler基因组注释方法EvidenceModeler用于将多种方法的注释结果合并整理 从头预测的结果，同源注释结果，RNA-seq辅助注释结果，EST注释结果等等。 ...
-
使用ChIPSeeker进行ChIP-seq， ATAC-seq，cut&tag等富集峰的基因组注释二代测序产生的数据类型 常规的下一代高通量测序（next generation sequencing, NGS）实验通常产生大量短片段(read...
-
第十七章 基因组注释
蛋白编码基因的注释 输入文件的准备 注释要注意基因组数据完整性和连续性，评估组装质量，这决定着注释结果的质量和准确性 需要以蛋白质序列、表达序列...
-
利用三代转录本升级基因组注释（gff3）因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因并不准确，三代转录组的广泛普及...
-
ChIP-Seq数据挖掘系列-4: liftOver - 基因组坐标在不同基因组注释版本间转换liftover 是UCSC提供的一个用于不同基因组注释版本间基因组坐标转换的工具。UCSC 提供了一个web版本；数据过多时用起来很不方便，也...
-
【基因组注释】同源注释比对软件tblastn、gamp和exonerate比较
基因结构预测中同源注释策略，将mRNA、cDNA、蛋白、EST等序列比对到组装的基因组中，在文章中通常使用以下比对软件： tblastn gam...
-
山羊(goat)转录组实战写给女朋友的教程 像人，小鼠这种模式动物，几乎所有比对软件的主页上都可以找到已经构建好的基因组索引文件。要使用的话，直接下载构建好的索引文件就可...
-
当小白遇到：参考基因组和基因组注释1、啥是参考基因组和参考基因注释？ 俗话说“大道至简”，咱生物界表示：这我熟呀！君不见，我只用ATCG 四个碱基就能上天入地，外加海底两万里。嗯...
专题公告
三代组装注释
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/2013825/crop1700273480852.jpg', '推荐专题《三代组装_注释_11.18.23》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/f07d87675236?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}