发简信
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镜像-docker转Singularity
前言 docker镜像极大方便了软件的使用，但docker对于集群用户却不友好，所有命令都需要root权限。近期在集群使用singularity...
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根据VCF文件设计引物
GitHub - Runsheng/primervcf: primderdiffer submodule: primervcf[https://...
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关于PhastCons和SIFT4G的使用
由于分析需求需要使用PhastCons分析DNA的保守序列，以及使用SIFT软件分析氨基酸变异的有害性，经过一段时间的探索，对这两款软件已经有了...
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利用三代转录本升级基因组注释（gff3）因为课题需要，我们在前期组装了一个基因组并进行了注释，但是存在两个问题，一个是没有考虑可变剪切，另一个是注释的基因并不准确，三代转录组的广泛普及...
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全长转录组更新
########更新版 minimap2生成的sam文件是没有header的，那使用samtools转bam并排序的时候会报错，这一部分可以自己...
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conda的一些使用问题
conda用起来有些小问题，之前一直未能解决，将这些记录一下 1 往集群投递任务同时激活conda环境 看资料上说是改配置文件啥的，改完之后也没...
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单拷贝直系同源基因构建物种进化树最近用Orthofinder做物种进化树，最后出来的物种树的结构跟已发表研究的结果差距较大，在我的印象里Orthofinder软件是用单拷贝直系...
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基因组共线性分析-JCVI由于忙课题的原因，断更了好久，虽然断更的时间内学习到了很多东西，但细想一下还是记录在自己博客里比较好，方便自己查阅也方便其他人学习 JCVI这个...