蛋白结构分析在线软件集锦 序列相关 密码子表达优化：Jcat 核酸翻译为蛋白：Translate 序列比对和搜索：NCBI Blast，Uniprot Blast，HMMER...
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蛋白结构分析在线软件集锦
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Maestro使用蛋白准备 蛋白从pdb数据库下载 下载pdb格式文件 小分子从pubchem或者zinc数据库下载 小分子下载sdf或者mol格式文件都可以 3.打开薛定谔软件，导入pdb文...
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烟草瞬时表达（亚细胞定位/BiFC）参考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
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生信log37|如何在HPC计算节点上获取进程资源消耗的信息及合理分配资源-深挖nextflow资源统计bash脚本知识点2有使用超算或者服务器的同学应该会接触过超算投递系统，在提交生信任务时，我们需要设置好资源，比如说cpu用多少，内存给多少。学生时代的我是有多大内存提供就设多大内存，有多少CP...
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集群服务器节点远程登录使用教程第一步：安装两个软件——XShell &Xftp。 XShell是用来远程控制集群节点的，以Linux命令行的形式运行程序。 Xftp是用来远程上传下载文件的，图形界面。 第...
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一个高杂合真菌基因组组装脚本（改代码版）
前言及背景 什么是基因组de novo测序？其是对某一物种进行高通量测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，在不依赖于参考基因组的情况下进行组装，从而绘制该物种的全基因组序...
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如何使用SPDE进行基因家族分析---蛋白结构域、启动子元件、保守结构域在进化树建完后，需要对序列的结构进行分析。这里需要区分两个概念，即蛋白结构域与保守结构域，它们两个不是一回事。从上一章，通过pfam方法同学们可以获得蛋白结构域的信息（即结构...
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CD-hit安装及使用
cd-hit是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具，根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列，一般用于构建非冗余的数据集用于后续的实验分析。 cd-hit聚类算法 通常来...
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时间序列的单细胞转录组数据分析利用时间是一个极其高级的规律。——恩格斯 单细胞转录组数据分析在阐述多细胞生物发育与疾病进程方面已经开发了多种新的方法，如比较有名的轨迹推断(TI，trajectory in...
