2022年，鱼跃龙门！积极主动，逆天改命！
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蛋白结构分析在线软件集锦
蛋白结构分析在线软件集锦 序列相关 密码子表达优化：Jcat 核酸翻译为蛋白：Translate 序列比对和搜索：NCBI Blast，Uniprot Blast，HMMER...
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烟草瞬时表达（亚细胞定位/BiFC）参考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
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生信log37|如何在HPC计算节点上获取进程资源消耗的信息及合理分配资源-深挖nextflow资源统计bash脚本知识点2有使用超算或者服务器的同学应该会接触过超算投递系统，在提交生信任务时，我们需要设置好资源，比如说cpu用多少，内存给多少。学生时代的我是有多大内存提供就设多大内存，有多少CP...
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集群服务器节点远程登录使用教程第一步：安装两个软件——XShell &Xftp。 XShell是用来远程控制集群节点的，以Linux命令行的形式运行程序。 Xftp是用来远程上传下载文件的，图形界面。 第...
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一个高杂合真菌基因组组装脚本（改代码版）
前言及背景 什么是基因组de novo测序？其是对某一物种进行高通量测序，利用高性能计算平台和生物信息学方法，在不依赖于参考基因组的情况下进行组装，从而绘制该物种的全基因组序...
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如何使用SPDE进行基因家族分析---蛋白结构域、启动子元件、保守结构域在进化树建完后，需要对序列的结构进行分析。这里需要区分两个概念，即蛋白结构域与保守结构域，它们两个不是一回事。从上一章，通过pfam方法同学们可以获得蛋白结构域的信息（即结构...
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CD-hit安装及使用
cd-hit是用于蛋白质序列或核酸序列聚类的工具，根据序列的相似度对序列进行聚类以去除冗余的序列，一般用于构建非冗余的数据集用于后续的实验分析。 cd-hit聚类算法 通常来...
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时间序列的单细胞转录组数据分析利用时间是一个极其高级的规律。——恩格斯 单细胞转录组数据分析在阐述多细胞生物发育与疾病进程方面已经开发了多种新的方法，如比较有名的轨迹推断(TI，trajectory in...
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（一）单细胞转录组数据分析之软件准备及环境搭建写在前面，为什么想着写单细胞转录组分析的教程？ 一方面是可以进一步巩固自己对单细胞转录组分析的理解，另一方面也可以通过自己现有的微薄单细胞数据分析理解，带领更多感兴趣的小伙伴...
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单细胞转录组数据分析流程回顾一下：什么是单细胞转录组测序技术？ 细胞异质性是生物组织的普遍特征。由于传统的转录组测序(RNA-Seq)技术的测序水平是在个体或群体水平上对数万个细胞进行转录组测序，因...
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单细胞转录组数据分析||界面版数据分析工具简介随着单细胞转录技术以及分析方法的成熟，人们基于已经成熟的命令行或编程工具陆陆续续来发出了在线分析平台和Windows（界面）工具。今天，卑微小王为大家介绍几款单细胞转录组界面...
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Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（九）- Scater包单细胞过滤
往期系列 Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（一） Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（二） Hemberg-lab单细胞转录组数据分析（三） Hemberg...
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一套比较简便的基因组组装流程V2.0
之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b188]，时间快2年了，现在新技术，新方法出来了，有更好的的方法...
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生信 | 基因组组装实战（四）：组装软件mecat2、flye、wtdbg2、Canu、Falcon写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组概念 基因组应该指单...
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