Tips: 最近看单细胞ChIP-seq 文章一个图，本来作者用base plot 画的，因此尝试用ggplot2 画出base plot 风格。 图表达意思：在小鼠胚胎发育...
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重复单细胞it-ChIP文章小图 -
使用deeptools将bam文件转换为bw文件整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供两个bam转换为bw的命令，分别是bamCove...
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GSA、GSEA、ssGSEA、GSVA的算法原理及它们的联系与区别一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息，多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中，基因集分析（Gene Set Analysis...
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用ggplot2做富集分析气泡图数据准备 富集分析软件由于做的材料不是模式植物，用clusterProfiler上面配置起来有点困难，最要命的是基因组数据库并没有上传NCBI，无法用OrgDb，当然也可以自...
