●英文题目：《The origin of domestication genes in goats》 ●期刊：Science Advances ●影响因子：2022_IF=1...
IP属地：江西
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2022-12-09 | 山羊驯化基因的起源 -
系统基因组学揭示了在快速辐射中三个适应性变异的来源
物种形成事件往往发生在快速爆发多样化的时期，但是促进这些辐射的生态和遗传因素仍存在很大的争议。使用所有的13个物种在生态上和生殖上多样化的野生番茄分支的转录组，我们推断了物种...
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fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
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beta/or, se, p, zscore换算总结帖
对GWAS的summary文件进行整合时，经常需要在beta，or, se, p, zscore之间进行换算，故在此总结一下。希望对大家有帮助。 1. se 计算 1.1 有...
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群体遗传学一-SNP calling
使用BWA+samtools+gatk4.0进行SNP calling 首先下载数据eg： 01.align 首先定义相关用到的变量，然后使用baw创建索引之后进行map。 ...
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复现文章中的基因进化树[MUSCLE+FastTree]写在前面 复现文章中的figure是检验自己是否完全掌握工具的使用最重要的方式，下面我以2019年南京大学杨四海老师发表在PNAS上的文章Large-scale identi...
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使用SNPhylo构建群体系统发生树
SNPhylo是一个基于SNP数据构建群体系统发生树的流程工具，它能接受VCF,HapMap和简单SNP数据格式作为输入，经过一系列的过滤（低质量数据、连锁不平衡）得到用于构...
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「资料分享」我在组内做了一次Linux入门培训
东西学到了就是你的 今天晚上在课题组内做了一次Linux入门培训，虽然培训时长花了大概70分钟的时间，而准备PPT和一些课程相关资料可能花了一天时间，但是为了能够有能力做这样...
