0.参考https://github.com/zhaotao1987/SynNet-Pipeline[https://github.com/zhaotao1987/SynNe...
IP属地：云南
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基于共线性网络构建物种进化树(系统发育) - SynNet -
生信分析22：完整的转座子注释流程本次推送是文献分享22的对应内容。我与生信，公众号：我与生信文献分享22：泛基因组解析柑橘亚科进化以及柑橘果实中柠檬酸积累的关键基因[http://mp.weixin.qq....
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WGDI - 推断祖先核型0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂具体每个参数的含义参照官方文档, 这里全部用默认参数https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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如何用WGDI进行共线性分析(上)多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一些共线性区域（即两个区域之间的...
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基因组基因复制的分类鉴定：DupGen-finder
参考：https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a[https://www.jianshu.com/p/0a14d971bd0a] requi...
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【比较基因组】McScan jcvi比较两个基因组共线性细节记录软件的安装 Python版McScan（jcvi工具包）：https://github.com/tanghaibao/jcvi[https://github.com/tang...
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比较基因组学分析1：构建单拷贝基因树比较基因组学分析目录 1：单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间[https://www.jianshu.com/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收缩与扩张分析[ht...
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生信分析29：基于单拷贝直系同源基因构建物种进化树本次推送是文献分享29的对应内容。 Fig 1 基因组和比较基因组相关的文章中，最常放的一个图是对该物种和其他近缘物种以及外群构建系统发生树（Fig 1），用来研究物种的进化...
