接上一节（【视频教程】Cellphonedb v5更新：python版Scanpy单细胞分析后续之cpdb细胞通讯[http://mp.weixin.qq.com/s?__b...
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【改装函数】弦图-可视化cellphonedb细胞互作结果 -
CellphoneDB 方法 3（差异表达）
在这个示例中，我们使用方法 3 (degs_analysis_method) 来研究在滋养层细胞 (Trophoblast) 分化和侵入母体子宫过程中，血管周细胞 (PVs)...
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CellphoneDB V5CellphoneDB工具通过利用我们的CellphoneDB数据库中与单细胞转录组数据交互的分子，提供不同的方法来评估不同细胞类型之间的细胞间通讯。 v5 的新特性 新的P...
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scRNA-Seq | SCENIC 推断基因调控网络和细胞类型转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合 (TFBS/motif) ，调控DNA转录过程的一类蛋白质。转录...
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无生物学重复的差异分析—Gfold一、安装gfold Gfold软件是做没有生物学重复样本首选的软件https://zhanglab.tongji.edu.cn/softwares/GFOLD/index.h...
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环状柱状图+散点柱状组合图绘制，基于SCIPainter原文教程：环状柱状图+散点柱状组合图绘制，基于SCIPainter教程[https://mp.weixin.qq.com/s/WohiJrhfXsW22xpaeTipRQ] ...
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R绘图—Ternary的绘制(三元图)三元图的应用场景：三分组以上, 直观展示某个因素（可数值量化的）在三个条件下的倾向性！ 1. 直观展示基因表达在三组的表达偏向性 首先清除环境，安装并加载所需要的R包 载入数...
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答读者问(8)：如何批量查询marker基因(对应的蛋白)会不会在膜上表达？做实验的朋友们对这个问题应该是很感兴趣的，因为涉及到后续能不能实验验证。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文献，查网站。我知道的：uniprot、PDB、the human...
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指挥chatgpt写一个调用自己api并回复问题的shiny程序自从chatgpt开放了gpt-3.5-turbo的API后，调用API的成本大大降低，今天使用网页版chatgpt写一个调用gpt-3.5-turbo进行聊天的shiny程...
