Seurat4.0系列教程告一段落，但这决不是终点。这个系列教程是给大家打开一扇窗，让大家知道Seurat4.0有这些功能可用，少走弯路。后续还要自己深入研究。学，然后知不足...
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Seurat4.0系列教程22：空间转录组的分析、可视化与整合 -
为什么要做空间转录组？
做完单细胞内容后，大家对于目标细胞群体应该有了初步的认识，但是仍然会有很多问题值得商榷，例如： 1.细胞类型鉴定完之后，可能会发现对照组和处理组的细胞类型差不多，但是表型却大...
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Seurat 新版教程：分析空间转录组数据随着转录组技术的发展，空间转录组已经正式走向商业化时代，作为单细胞数据分析的工具箱的Seurat与时俱进，也相应地开发了空间转录组分析的一套函数，让我们跟随卑微小王看看Seu...
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解决conda环境中R包hdf5r编译失败的问题
安装Signac包后发现无法使用read10X_h5函数，缺少hdf5r包install.packages("hdf5r") 后遇到error:global.h:23:10:...
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R语言：更改R包安装路径1.R Studio- Tools -Global Options，General Basic中有R的基本信息，可以从这里看到（记不清了的）R的安装路径 2.在路径里找到 e...
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R语言小需求：更改R包安装路径，给C盘释压C盘是系统盘，我们都知道能不把软件装在C盘就不装在C盘，之前用R语言跑过一些代码，一直记着这个需求，今天抽空花一点时间把这个需求满足了。 ①Step 1 任意目录下新建一个R...
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十一步带你解构GEO分析常规流程（一）PDAC数据分析-GSE16515-GPL570 致读者语：本人接下来的九篇GEO解析文章将基于此，不断进行迭代，尝试让核心步骤、让图文与让结构更加美观,让读者与自身更能直击...
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使用Rstudio下载GEO芯片数据学习GEO芯片数据下载时踩了各种坑。记录如下：跟从老师讲解，尝试使用GEOquery下载： 报错。下载龟速，且报错 Timeout of 60 seconds was rea...
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2021-05-23 ChIP-seq数据从头到尾比对及分析汇总（个人分析记录贴）0_1 前言 有时间再详细写introduction。先把我分析数据的流程记录下来，后续持续更新。 0_2 用到的软件或脚本 测序数据质控：fastp[https://git...
