可能性之兽

全基因组关联研究（GWAS）已经确定了数千种与许多复杂特征相关的遗传变异。然而，它们的生物学机制在很大程度上仍然是未知的。最近提出的全转录组关联分析（transcriptom...

Wei_Sun

韦恩图，Venn diagram，常用图的一种，用来展示集合之间的特异性和共同性。现在有很多在线的网站都可以绘制，但是R来画也方便，其中ggvenn是基于ggplot2的专门...

小潤澤

前言 我们知道GWAS描述的是snp与表型之间的关系，即利用线性模型寻找与某种性状显著相关联的位点。但是发挥生物学功能的往往是蛋白质，蛋白质是由转录本翻译而来，那么建立基因表...

生信石头

“MEGA是一款免费的生物信息学软件，可以用于分子进化的各个方面，包括序列比对、构建进化树、分子时钟分析、种群遗传学、序列分类等。除了一般的序列文件，MEGA还可以用于处理分...

谢俊飞

网络上关于构建进化树的教程非常多，这里只挑重点部分讲解。 常见算法：Neighbor-Joining、Maximum Likelihood 1. 参数设置： Test of ...

爱吃海椒的妹妹

此处与云养江停的文章有略微差距 一.SNP calling 参照文章gvcf文件与vcf文件 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...

爱吃海椒的妹妹

一、Fst含义 群体间遗传分化指数（Fst）：是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。Fst居于０~1之间，越接近1表示两个群体之间分化程度越大，受选择程...

EwanH

基本概念： 基因流（也称基因迁移） 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非...