hello,上一篇文章中，10X空间转录组数据分析之空间注释（解卷积，STdeconvolve）[https://www.jianshu.com/p/d213c53ef003...
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10X单细胞空间联合分析之十（RCTD） -
CIBERSORT：反卷积推测bulk中的细胞类型五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT，这个包其实很早就想学的，因为现在一般的单细胞文章的套路，很难不用到它，那么它能干什么呢？它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
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组间差异检验，终于有人讲清楚了!什么是组间差异检验？就是组间的差异分析以及显著性检验，应用统计学上的假设检验方法，检验组间是否有差异及其差异程度。坦率地讲，所有的差异检验都基于一个假设：组间没有差异，变量之...
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R-SCENIC 单细胞转录因子调控网络分析文章接受，终于有空再发点笔记了😃 SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Packages[#load-pack...
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TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)数据库分析肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况TIMER (Tumor Immune Estimation Resource)数据库也是用高通量测序(RNA-Seq表达谱)数据分析肿瘤组织中免疫细胞的浸润情况，主要提供B...
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RNA-seq完整分析过程linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是一个Python下和Canop...
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适用于scRNA-seq的细胞通讯工具-2：CellChat现在开始学习第二个适用于单细胞转录组数据的细胞通讯工具:Cellchat,也是比较常用的。相较于CellphoneDB的数据库(配体-受体+多聚体),CellChat在模拟细...
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适用于scRNA-seq的细胞通讯工具-1：CellphoneDB先记录一下，我安装过程的惨痛经历😭，希望小伙伴们避免像我一样入坑。起初每一次安装，不论是使用conda还是pip工具，发现安装好的CellphoneDB（4.0.0）在she...
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博士生指南 | 读博路上那些忠告，献给你们！
我们读过所有的书都不会白读，它总会在未来的某个场合，帮我们表现得更出色。 一、学术篇 01 不要对自己的潜力做太大指望 一开始你会觉得你获得诺奖级别成果，后来你想着能发 Na...
