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单细胞差异基因展示图最近看到一个公众号，分享了一个图片，公众号的名字为西红柿的空间转录组，代码均来着这个公众号，废话不多说，先看看图长什么样 直接上代码 加载数据与包 再看一下图片，我们要构建一...
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单细胞分析实录(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵Cell Ranger是一个“傻瓜”软件，你只需提供原始的fastq文件，它就会返回feature-barcode表达矩阵。为啥不说是gene-cell，举个例子，cell ...
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用随机森林算法进一步筛选差异表达基因前言 很多时候，我们分析完差异表达基因后，发现会得到一大堆差异基因，常见的做法有降低Pvalue的阈值，挑选fold-change最大的基因，做通路富集然后挑重要通路上的基因...
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WGCNA实例分析及解读（附代码）WGCNA分析基于两个假设：1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路，2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点，可以将基因网络根据表达相似性划分为不同的模块...
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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
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表达矩阵log后进行差异分析关于limma包差异分析结果的logFC解释 http://www.bio-info-trainee.com/1209.html 首先，我们要明白，limma接受的输入参数就...
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蛋白质经泛素-蛋白酶体降解研究基本思路（图文详解）泛素和泛素化介绍 泛素 泛素为含76个氨基酸、大小约为8.6 kDa的小蛋白质，在真核生物中普遍存在且高度保守。人类基因组中的四个基因编码泛素：UBB，UBC，UBA52和R...
