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  • 请问为什么我替换位点“.”为“./.”之后,文件变成了二进制文件啊?运行beagle时显示Error reading variant.vcf.useimputation.gz,查看文件时显示"variant.vcf.useimputation.gz" may be a binary file. See it anyway?

    Beagle填充报错|java.lang.IllegalArgumentException

    报错详情 报错查询 根据报错提示定位样本12的1:8271179 SNP 解决方案 替换该位点“.”为“./.”,同时注意到第三列SNPID也是单独的“.”,为此仅替换从SN...

  • @Jiao_35aa 我也遇到了这个问题,请问您解决了吗~

    「基因组注释」MITE-Hunter鉴别基因组的MITE序列

    背景篇 MITE属于II类非自主转座因子,并且在真核生物中存在大量的拷贝。 MITE长度大约是500bp,并且扩增速度非常快。2013年一篇发表在NAR的文章"P-MITE:...

  • 请问只下载单个数据的时候,era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:vol1/fastq/SRR142/075/SRR14209175/SRR14209175.fastq.gz 这部分的内容是从哪里获取的呢?谢谢

    秘籍 | 惊了,使用aspera下载SRA数据速度高达 291Mb/s

    2024年5月20日更新:目前大家可以参考这篇👇,更加方便:生信 | 超便捷!iSeq同时支持快速下载GSA/SRA/ENA的数据[https://www.jianshu.c...

  • @DumplingLucky好的,谢谢您~

    pi, Fst, dxy, fd的计算

    有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算: pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程度 dxy, 对核苷酸多样性绝...

  • @DumplingLucky 作者您好,谢谢您的回复,我想确定下这种文件的格式是怎样的,您看下我构建的对吗?
    contig=<ID=CM032034.1,length=75861420>
    contig=<ID=CM032035.1,length=62787994>
    contig=<ID=CM032036.1,length=62690366>
    contig=<ID=CM032037.1,length=56486944>
    contig=<ID=CM032038.1,length=42119227>
    像vcf文件中的那样,谢谢

    pi, Fst, dxy, fd的计算

    有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算: pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程度 dxy, 对核苷酸多样性绝...

  • 您好,请问从哪里下载chrEnds.txt文件呀,我看链接中没有该文件,也没有找到作者的邮件,请问您可以发一下该文件吗?谢谢

    pi, Fst, dxy, fd的计算

    有许多不同的统计量可以衡量差异选择的区域或基因渗入障碍的区域。这里介绍常用的四个统计量的计算: pi, 衡量遗传多样性 Fst, 衡量群体分化程度 dxy, 对核苷酸多样性绝...

  • 你好,请问我生成的表格中很多都是nan,这是代表什么意思呢?

    Fst/Pi/Dxy的计算、基因岛屿与曼哈顿图(1) - 个人笔记

    待更新 2020.5.10 -1.把Fst值较高的区域(比如前百分之1)当成岛屿(或者Dxy值,这里以Fst为例)(但为什么要这样做我并不明白)。 0. Fst/Pi/Dxy...