前言 来到这里，已经渐渐不是人话了... 估计这辈子我也没有想到，我把我最厌恶的东西写出来， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，这一小节吐槽官网的这一行代码，大神请...
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GWAS分析-说人话（20）-单倍体关联分析 -
Linux中pong 的安装和使用引言 pong可用于admixture结果可视化 官方网址：GitHub - ramachandran-lab/pong: Fast analysis and visuali...
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ROH分析流程及各种参数的选取1前言 ROH参数的设置越看越复杂《How to study runs of homozygosity using PLINK? A guide for analyzing ...
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DRAGEN: 硬件和软件共同加速的变异检测工具
这是一篇工具介绍贴，考虑这个工具是要钱的，那些动不动就说别人忘了初心的用户肯定认为我写的是软文，所以这些人就不要继续往下看了。 变异检测的软件目前虽然有很多，SAMtools...
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ROH、近交系数、亲缘系数、IBD、IBS连续纯合片段（runs of homozygosity, ROH）是亲代将同源相同的单倍型传递给子代而形成的，基于ROH计算的基因组近交系数是个体真实的近交系数，它比传统系谱...
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群体结构分析 | Pophelper 的“平替版”写在前面 终于到了这一天，我又捡起了七八年做群体分析的技能....只是那会我画图就用 ggplot2，而现在我只用「TBtools」。基于重测序数据的群体结构分析，很多时候，...
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遗传多样性软件 CLUMPAK 使用说明CLUMPAK是一个perl脚本，需要提前按照说明书使用cpanm或conda安装所需模块官网[http://clumpak.tau.ac.il/index.html] st...
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GWAS之表型最优无偏预测（BLUP)与遗传力计算表型分析之最优无偏预测 最佳线性无偏预测（Best Linear Unbiased Prediction，简称BLUP）可以对多环境数据进行整合，去除环境效应，得到个体稳定遗...
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Tips | 基于物种科学双名列表获取物种进化树（带推测的演化时间）~Emmm，相关推文前述邀请了朋友写过，不过今天老邱问我能不能优化一下 TBtools 的进化树解析功能时，我还是看了一下，发现，用「TimeTree」网站，基于物种双名获取一...
