主成分分析（Principal component analysis，PCA）是将多个存在相关关系的变量，降维为几个互不相关的指标，也就是主成分。我的数据相对来说，有点复杂，...
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3.表型数据：主成分分析 -
全基因组选择的模型汇总（转载）本文转载自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。个人感觉非常好。如有侵权，请联系我。...
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3 - BLUP的基本特性及求解方法回顾上一次的一个OLS, GLS，SI, MME的发展示意图： MME是Henderson将混合模型的转换得到 1 MME的起源 Henderson提出，其想法是结合OLS与...
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RIdeogram：染色体数据可视化的R包已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在线工具Idiographica，虽然能绘制直的...
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使用RIdeogram绘制染色体图谱参考文章：https://www.jianshu.com/p/07ae1fe18071需求描述：我想绘制差异表达基因在染色体上的分布，或开放染色质在染色体上的分布或CTCF在...
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karyoploteR: 画一个测序深度分布图测序深度的分布图是很常见的一类图，可用于发现染色体片段或整条染色体的缺失或是重复。如果是缺失，测序时捕获的概率就小，最终比对呈现出来的就是有一段区域深度明显偏低；如果是重...
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SNP在染色体上的密度分布图有两种方法，先看比较简单的一种： 结果： 第二种方法就比较复杂了，需要准备两个文件：一个是包含染色体长度的文件chr_length.txt，格式如下： 一个是包含各个基...
个人介绍
毕业于山东大学，具有6年生物信息分析工作经验，一直从事动植物及人的重测序方向。擅长群体重测序及GWAS分析；进行过NIPT，CNV，肿瘤ctDNA，遗传肿瘤等人类健康方向相关的分析；使用linux，perl，R，git等