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有两种方法,先看比较简单的一种: 结果: 第二种方法就比较复杂了,需要准备两个文件:一个是包含染色体长度的文件chr_length.txt...
1、RRBS简介 RRBS即reduced representation bisulfite sequencing:第一步:使用MSPI内切酶处...
1、加载需要的包 2、导入数据 我这里的数据其实就是一列基因名,是通过其它分析挑选出来的几百个基因,想要看看这些基因是否能够富集到某些特殊的通路...
数据格式如下: 若某个基因在某个样本中既有deletion又有mutation则以;分隔 结果如下: 其中oncoPrint()中有些参数可选,...
Blast 的运行方式是先用目标序列建数据库(这种数据库称为database,里面的每一条序列称为subject),然后用待查的序列(称为...
https://academic.oup.com/nar/article/43/9/e61/1113203/multiSNV-a-probabi...
代码如下(perl):