还记得之前我们发过的热图吗? 样品之间聚类的时候发现对照和实验组混合到了一起。这是由于样品一致性差造成的,这种情况很多时候都会遇到。一般的做法是放弃列的聚类。但是我不,很多文...
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还记得之前我们发过的热图吗? 样品之间聚类的时候发现对照和实验组混合到了一起。这是由于样品一致性差造成的,这种情况很多时候都会遇到。一般的做法是放弃列的聚类。但是我不,很多文...
适用背景 在R语言中,我们需要对字符串、向量和数据框等数据类型进行替换操作,有时候是因为需要更换别名,有时候是因为数据存在错误需要修正,有时候则是因为需要删除某些信息。本文将...
简要内容--拟时序分析的定义--结果解读--------做出结果(cluster、state)--------确定起始点--------做start····end的图(并且映...
前言 最近刚回来,发现实验室服务器各种bug,首先apt升级了一些软件,然后老版本的R 3.3.1升级到了3.6.1,于是乎出现以前安装的包不能在当前版本用 于是跟着更新了一...
提示信息是 别人有的说是被防火墙拦截了,要重新设置什么的,看了一下太过于麻烦,但是从另一位[网友](https://www.jianshu.com/p/0f9e5ae6564...
首先是构造数据 set.seed()这个函数大家可能经常会看到这个函数,他的作用是保证自己模拟的数据和示例代码完全一致 作图是用groups做x轴,type填充颜色,每个gr...
部分示例数据如下 第一列是数值 第二列是处理一-第三列是处理二 最终出图如下 这里自动做统计检验的函数是 stat_compare_means() 首先是做箱线图和小提琴图的...
关于什么是“拟时序分析”,可以参考本期推送的另一篇推文。这一篇直接演示代码 monocle2这个软件用得太多了,很多文章都是monocle2的图。因为只使用表达矩阵作为输入,...