宏基因组和16s的相关分析流程、方法、所用工具
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微生物宏基因组
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微生物组16S rRNA数据分析小结: qiime2-2019.1本次笔记内容：qiime2-2019.1的16s分析流程，以没有barcode，以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...
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欢迎大家分享自己在完成生信技能树linux作业时的笔记心得 。 生信人的 linux 20题 <http://www.bio-info-trainee.com/2900.html 处理 fastq,fasta,sam,bam,vcf,gff,gtf,bed,MAF等**格式（约定成俗，大牛推广）**的数据 fasta和fastq格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3575.html sam和bam格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3578.html VCF格式文件的shell小练习 http://www.bio-info-trainee.com/3577.html
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学习小组Day7笔记--五颗糖1.思维导图 2. 一代测序 sanger法测序（“双脱氧终止反应法”，观看）：顾名思义，DNA在聚合酶的作用下进行无数次合成，每次到了ddNTP就终止，这样就得到不同长度的...
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学习小组Day6笔记--五颗糖
1.R包的安装 首先install.packages(“包”)如果包不好安装可以下载压缩文件进行本地安装。然后选择镜像最后（二者选一个）library(包) require(...
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学习小组Day5笔记--五颗糖1.思维导图 2.R中5类数据结构 向量 （vector）：最简单的数据结构如c(1,2,3)或者c("a","b")都是向量。矩阵（Matrix）：这里的矩阵和线性代数中的...
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学习小组Day4笔记--五颗糖
1.写在前面的话 我对于R语言的学习，大概起步于三四年前，科研上的画图确实离不开R，画图很好看，特别在统计分析那一块，R语言的优势是很大的，一些R包的使用也非常方便快捷，但长...
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学习小组Day3笔记--五颗糖1. Linux系统下软件的安装-入门 linux的应用商店conda的安装conda可以为Linux系统下安装软件提供一个平台，需要的软件可以从中搜索并安装，因此我们需要先...
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《学习小组Day2笔记--五颗糖》1.思维导图 2.登陆Linux 下载Putty软件进行远程登陆（需要用户名和密码）登录系统后的界面 3.Linux常用基本命令 显示当前路径：pwd （print work...
