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您好，就是我在对两个基因组进行共线性分析的时候，跑出来的结果文件里染色体和基因id前面会缀有spe414或者是spe273（spe后面的数字会有变化）这是为啥啊？怎么才能不让带这个前缀！！！求解答，感谢🙏🙏🙏
用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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如何使用SPDE进行共线性分析（MCScanX）在进行共线性分析的时候需要准备两个文件：一个是blast文件，一个是gff文件。这两个文件都是需要经过相应处理的。在这里还是稍微跟同学们说一下原理：共线性的本质其实就是找序列...
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@小白菜学生信 那这个怎么设置参考蛋白文件呢？泛基因组不是有个参考基因组吗？
BPGA分析细菌泛基因组
导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写，16年发表的工具，17年最后一版更新，内置KEGG COG数据（老了），依赖use...
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五. 基因组共线性分析-基于MCscanX一. 简介 MCScanX是由福建农林大学唐海宝老师参与开发的基因组共线性分析软件，发表至今引用数200以上，相关概念和算法参考文献如下： Tang H, Bowers J ...
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用TBtools，快速高效实现基因组共线性分析与可视化， 赞！写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴，可以通过以下几段内容，了解一下，我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
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插件 | 超快！全基因组共线性分析写在前面 伴随着越来越多的全基因组序列公布，比较基因组分析已然常规生信数据分析技能。MCScan 是最为常用的软件之一。久前，TBtools 已经将该软件打包，同时开放了一键...
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这个软件做泛基因组，需要的是蛋白文件，不是基因组文件和基因组注释文件吗？求解答！！！
BPGA分析细菌泛基因组
导读 BPGA是Bacterial Pan Genome Analysis tool的简写，16年发表的工具，17年最后一版更新，内置KEGG COG数据（老了），依赖use...
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那个增加一列比率，bgitem代表的是啥啊？我的txt文件里没有这一列
2021-03-23 GO富集分析气泡图
先在AgriGO[http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/specises_analysis.php?&SpeciseID=18&...
