发简信
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Linux中利用MD5值检测测序数据完整性
md5sum命令简介 md5sum 用于计算和校验文件的MD5值，md5sum命令用于生成和校验文件的md5值。它会逐位对文件的内容进行校验，与...
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下载R旧版本更新R到最新版本以后，下载包各种报错，怀疑是版本问题，然后下载了旧版的R,问题得到解决。 下载地址 https://cran.r-project...
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DNA甲基化分析④去重复＆计算胞嘧啶的甲基化值
1、去除冗余的reads 结果： 2、将bam文件转化为sam文件 结果： 3、计算每个胞嘧啶的甲基化值 结果：
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DNA甲基化分析③使用bismark比对
1、将参考基因组进行重亚硫酸盐的预处理转换 结果： 2、将数据比对到已经转化了的参考基因组上 一次处理单个样本： 一次处理多个样本： ps:--...
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DNA甲基化分析②数据质控质控原则 好的结果需要好的数据。原始下机测序数据(raw data)中，有些reads包含有测序接头序列，这些序列不属于测序物种中的原有序列，因...
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DNA甲基化分析①数据及软件准备
（上接Mimiconda的安装与配置） 1、上传和下载数据 创建WGBS文件夹用来存放测序数据和参考基因组序列数据 下载参考基因组和注释文件 G...
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修改Linux命令提示符的颜色
bash背景下 linux命令提示符由“username@主机名+路径”构成，默认的命令提示符颜色为白色，我们可以根据自己的喜好来修改命令提示符...
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Linux新用户登录时出现“-bash-4.2$”的解决方法
Linux服务器新建立的用户在登录时显示“-bash-4.2$”，而不是“user@主机名+路径”的显示方式。出现的此问题的原因是在添加普通用户...
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Miniconda的安装与配置
Miniconda的安装与配置 1、简介 Conda 是为 Python 程序创建的是一种开源的软件包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的...