通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
通过前期的分析,我们确定了感兴趣的module,但是module中又含有几十甚至上百的基因,下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA(3):基因模块与性状关联识别重...
本次分享的文献是发表在Nature plant上的一篇文献,题目是 "Genomes of early-diverging streptophyte algae shed l...
请问TSS region可以设置-2000 0吗?
chipseeker包的一些参数上的理解关于tssRegion参数: 理解:1、TSS是: 转录时,mRNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基它的上游是promoter它的下游就是相应的基因 2、做注释的时候,需...
刘小泽写于19.1.20-21要进行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每个基因对应什么样的GO/KEGG分类,OrgDb就是存储不同数据库基因ID之间对应关系,以及基因与G...
Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源,是指不同物种之间的基因,起源于共同的祖先,基因功能可能一样,但又因为进化的关系,使得功能有...
重建系统发育关系=分子数据建树? 一提到phylogeny,我们的第一反应就是分子数据建树。这种理解是片面的,但也反映了一些它的分类学的区别: 首先,分类学在根据charac...
主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示,箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的,包含6个数据节点,分别表示出数据的上边缘、上...