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我没有仔细看，谢谢提醒
常见免疫治疗队列的表达矩阵
生信文章中经常用到免疫治疗队列来验证构建的signature能否预测免疫治疗的疗效，常用的免疫治疗队列包括：IMvigor210 (膀胱癌)、GSE91061（黑色素瘤）、G...
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又见“水刊”高质量生信文章大家好，今天要和大家分享的是2021年10月发表的一篇文章：“Pan-Cancer Analysis of Glycolytic and Ketone Bodies Meta...
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【科研热点】免疫检查点相关基因前面小编跟大家分享过一些科研热点相关的基因集 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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公众号 生信小课堂
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6.5分SCI，铜死亡+模型+单细胞+实验验证，铜死亡生信（3）
铜死亡生信分析的文章已经渐渐出来了。作为一个现象级热点，必然是会被反反复复研究和发表的。小编做的铜死亡生信文章也已经发表数篇，肿瘤和非肿瘤都有。铜死亡相关的生信在肿瘤和非肿瘤...
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单细胞转录组分析---Scanpy（1）我们前面也分享过很多篇关于Seurat的使用，尤其是在单细胞转录组分析上，今天我们来分享和学习另外一个和它齐名的工具：scanpy。也许有人会说单细胞分析使用Seurat，m...
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胶质母细胞瘤免疫亚型分析+免疫组化发8+分SCI今天给大家介绍一篇2022年1月发表在OncoImmunology（IF:8.110）上的一篇文章。本研究作者对单细胞转录组和bulk转录组数据集进行分析，鉴定到了一个新的G...
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TCGA泛癌TMB计算在前面系列教程中分享了如何下载TCGA表达矩阵（2022新版TCGA数据下载与整理[https://www.jianshu.com/p/98902a1bfb21])，通过R进...
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ggplot2 |legend参数设置，图形精雕细琢
本文首发于微信公众号“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/A5nqo6qnlt_5kF3_GIrjIA 学习了ggplot2|详解八大基本绘图...
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aglient芯片原始数据处理本文讲的是aglient芯片原始数据的处理，参考资料是limma 的userguide文档。GEO数据库下载的表达矩阵不符合预期，比如是空的，或者是有负值的，那我们就处理一下...
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GEO数据集如何根据序列信息重注释出全Gene symbol一个朋友的文章被审稿人质疑数据真实性，如何凭实力Argue？（明明这个数据集的平台注释文件没有lncRNA吖，你的数据集怎么会有的，我对你的数据真实性持严重怀疑态度） 数据集...
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请问老师coxBoost变量筛选的代码怎么写🙏
CoxBoost
单纯的COX模型可解释性很强，但是预测性能不能满足我的要求，所以采用花式优化COX模型。想了两种方法，一种是用Boosting，Bagging，方法二是提取主成分。然后今天搜...
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CoxBoost单纯的COX模型可解释性很强，但是预测性能不能满足我的要求，所以采用花式优化COX模型。想了两种方法，一种是用Boosting，Bagging，方法二是提取主成分。然后今天搜...
