pymol安装自用教程 pymol是一款蛋白质三维结构可视化软件，基于python语言，所以在安装前需要先安装python为其创建运行环境。 目前我安装的python是3.9...
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pymol安装自用教程+常用命令 -
RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
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InterProScan 最强基因功能注释软件 - 最简流程代码参考官方文档，目前 Interproscan 本地版几乎免安装，自带数据库，使用简单。 下载与安装 跳转到软件放置目录 注意到软件依赖 Java11 或者以上 使用软件 蛋白...
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更准确！ | 在笔记本上对重测序数据 Call Indels，提高分子标记开发效率写在前面 早前，TBtools 重测序三兄弟插件释放，主要完成了三个事情： BWA-MEM2 GUI Wrapper 进行读段回贴 SAMTOOLS GUI Wrapper ...
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零基础 | 基因在物种演化尺度的获得与丢失分析写在前面 当我们关注某个基因时，在计划对其开始基因功能研究之前，往往需要先做「基因家族分析」，原因有几： 通过演化树分会初步判断基因可能功能； 是确定其是否有替补队员（如此敲...
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巨坑！基因家族鉴定/分析，基因功能研究，一步之差，努力白费！写在前面 不知为何，几乎每天我都会收到一些「基因家族分析」的论文审稿邀请，其中质量参差不齐，但有不少论文作者团队非常友好，总是留下一个非常好提问机会。那就是「基因家族成员序列...
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【ProteoWizard MSConvert】质谱文件格式简介及其转换质谱格式 质谱文件格式多种多样，各仪器厂商产出的数据都有不同。虽然HUPO已经对质谱数据进行了标准化，但大家依然是我行我素，因为不得不用它们提供的软件，而不同的软件会要求不同...
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Autodock分子对接完结&总结1.Grid （1） 打开蛋白，“Grid->Macromocule->Open”，打开“r.pdbqt”。弹出的对话框，点击Yes及确定 （2） 打开小分子，“Grid->...
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SPAdes组装二代、三代测序数据导读 SPAdes是2012年发表在Journal of Computational Biology上的一篇文章提出的二代测序组装软件，是目前引用量已经达到6200+，在宏基...
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细菌基因组拼接工具比较（二）2021.3.18持续更新中。。。目的：比较下目前常用的四款拼接软件：Velvet、SPAdes、SOAPdenovo、ABySS 1. FastQC —— 质量评估 Fas...
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SnpEff结果解读SnpEff结果文件的解读 根据上一篇简书中SnpEff结果产生的4个文件进行解读 第一个文件：positive.snp.eff.vcf 其实positive.snp.eff...
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组装评估软件Quast和BUSCOQuast 通过计算各种指标来评估基因组组装。它既可以使用也可以不使用参考基因组安装：wget https://sourceforge.net/projects/quast/...
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基因组组装—SOAPdenovo2的使用一、简介 SOAPdenovo2是用于short-read组装的软件，能够组装出类似人类基因组大小的de novo草图。SOAPdenovo主要用于大型植物和动物基因组的组装...
