昨晚和大神网管求助后,一大早就告诉我能用了。 也不纠结怎么安装了,能用是硬道理。之前学的conda安装和虚拟环境知识也能用上,深感安慰。 教程: 一、进入R,安装各种包(失败...

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基本思路就是利用phylosuite软件下载序列,串联寻找mrbayes和iqtree软件的模型,然后用多线程的mrbayes和iqtree跑树。 1.第一步利用phylos...
推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法(ML)构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...
IQ-TREE是一款用于系统发育推断的高效软件(Efficient software for phylogenomic inference),其主要具有以下特点:1.高效的树...
导读 barrnap预测细菌基因组16S,获取结果文件第二行最长16S,保留>1400bp的16S。mafft做序列对齐。trimal修剪序列。fasttree建树。ggtr...
Picture的类型 Figure里面的图片主要包括位图和矢量图两种。 1.位图,一般是由显微镜、照相机等等直接获取的实验图像,其特征是放大之后,图片会模糊;图片像素越高,文...
前段时间,发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门,但在准备数据分析的过程中,仍感各种资料教程之零散,各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此,列出个人...
SSR (Simple Sequence Repeat),即简单重复序列,是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,也称为微卫星序列或者串联重复。 简单重复顾名思义就是以...