蜡笔小翔

昨晚和大神网管求助后，一大早就告诉我能用了。 也不纠结怎么安装了，能用是硬道理。之前学的conda安装和虚拟环境知识也能用上，深感安慰。 教程： 一、进入R，安装各种包（失败...

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基本思路就是利用phylosuite软件下载序列，串联寻找mrbayes和iqtree软件的模型，然后用多线程的mrbayes和iqtree跑树。 1.第一步利用phylos...

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推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进展中已经成为了必不可少的“套路...

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导读 barrnap预测细菌基因组16S，获取结果文件第二行最长16S，保留>1400bp的16S。mafft做序列对齐。trimal修剪序列。fasttree建树。ggtr...

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Picture的类型 Figure里面的图片主要包括位图和矢量图两种。 1.位图，一般是由显微镜、照相机等等直接获取的实验图像，其特征是放大之后，图片会模糊；图片像素越高，文...

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前段时间，发表了一篇叶绿体基因组比较分析文章。尽管这类套路文已经不再热门，但在准备数据分析的过程中，仍感各种资料教程之零散，各种文章的做图工具也是令人眼花缭乱。故此，列出个人...

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SSR (Simple Sequence Repeat)，即简单重复序列，是一种以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，也称为微卫星序列或者串联重复。 简单重复顾名思义就是以...

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NOTE 基于种群聚类,特有等位基因 基本概念 1 多态性条带 个人理解就是ssr引物1 在位点 扩增出的 a b 2个条带（2倍体），ab长度可能相同也可能不相同。如果a条...

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图片中的这个质粒长度为7338bp，其中含有1200bp的插入片段，现在我们使用两个限制性内切酶来切这个质粒，这两个限制性内切酶分别为HindII与BamHI，酶切的结果如下...

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写在写在前面的前面 或许，没有人知道TBtools到底是什么？能干啥。但是看完这个推文，或许你就知道了其中的一部分。 写在前面 TBtools对外开放两年多，不时会有熟悉的不...

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一：准备文件 1. 拟南芥的基因组，CDS，蛋白，GFF以及HMM文件。 2.利用HMM文件搜寻pep文件 3.利用clustalw进行多序列比对，构建物种特定的NB-ARC...

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参考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...

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写在前面 「育种」是目前大多关心的事情。杂交育种仍然是目前最为常用的育种手段。任何方法创新的优异材料，下一步都可能应用于杂交育种。反过来，「基因定位」则是基于杂交群体，开发分...

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背景 在最开头，我们来说下两种遗传模式： 1核基因组是双亲遗传的（一条染色体来自母本，一条来自父本），只有性染色体是单亲遗传的，但不是所有生物都有性染色体。 2细胞器基因组是...