该模块主要用于KEGG分析以及作图。首先，需要得到相应基因的KEGG以及KO IDs: 输入文件是先前的比对文件，选择近缘物种，然后保存并命名，之后点击“search”，会出...
IP属地：湖南
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GFAP---KEGG analysis模块 -
GFAP---pfam_go_kegg模块后来发现，即便努力实现了各科代表物种的注释，但在某些情况下还是直接注释可能更方便些。于是对GFAP添加了一个新的模块，该模块直接用pfam, GO, KEGG官网数据进行注释...
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GFAP---GO analysis模块GO富集分析是基因功能分析中非常重要的一个大类，其主要的作用是为了人们提供基因发挥作用的类型指导，即感兴趣的基因到底在哪些生物学进程中发挥作用。在GFAP中，可以根据近缘物种...
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生信常用数据库（三）：SwissProt和TrEMBL数据库搭建
前言 UniProt是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库，由两大部分组成，SwissProt和TrEMBL，SwissProt为高质量的、手工注释的、非冗余的数据集，Tr...
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plink 进行LD过滤SNP过滤要进行LD过滤，本文用plink进行LD过滤。版本：PLINK v1.90b7 64-bit (16 Jan 2023) 一、染色体格式转换和添加ID列 plink...
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群体杂交渐渗基因流软件基因型填充 - fillGenotype - beagle 基因型填充(Genotype-Imputation)：从原理到操作 - 知乎 (zhihu.com)[https:...
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GeoDa莫兰指数、局部莫兰指数的生成及制图莫兰指数具体分为全局莫兰指数（Global Moran's I）和局部莫兰指数（Local Moran's I）两种，是用来测算空间关系的一种相关系数值。实际研究过程中，通常...
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安装BUSCO和简单使用
BUSCO的主页 https://busco.ezlab.org/[https://busco.ezlab.org/] 直接选择conda安装了 报了很多错 暂时不清楚是什么...
