zhuang_gj 2020/10/11 ssGSEA算法原理及应用[#ssgsea%E7%AE%97%E6%B3%95%E5%8E%9F%E7%90%86%E5%8F%8A...
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ssGSEA算法原理及应用TCGA数据 -
【代谢组学】4.生物标志物分析概念 生物标志物，即传说中的biomarker，是一类可测量的，用来表征疾病状态的物质，通常用于表征： 疾病的状态（是否为某种疾病/某种亚型）； 药物敏感性，用于用药指导； ...
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ROC曲线——相关文献实例、原理和绘制方法前言 最近接触到ROC曲线相关的问题，因此下面整理出相关的文章，记录相关原理和应用。 数据分析最让人着迷的一种用途是可以基于现有数据创建能够区分不同类型情景的机器学习预测模型...
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WGCNA（6）：筛选 hub gene通过前期的分析，我们确定了感兴趣的module，但是module中又含有几十甚至上百的基因，下一步需要进一步筛选hub gene。 WGCNA（3）：基因模块与性状关联识别重...
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TIMER20和cibersort一个既能分析测序数据（最好是TPM格式），又能分析芯片数据的网站细胞免疫浸润网站使用 1.cibersort 数据输入格式：输入数据的要求： 1.不可以有负值和缺失值 2.不要取log 3.如果是芯片数据，昂飞芯片使用RMA标准化，Ill...
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【块】Gene id格式转换的多种方法
本文将逐步增加各种方法，有时间再研究各个方法的区别。每个人在转换id格式时，可能会遇到很多与以下流程不同的情况。比如说gene id有小版本、去重后数据大量丢失等等，建议具体...
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WGCNA（7）：重新绘制GS—MM散点图GS-MM散点图用于筛选hub gene，但是之前的图实在是有点丑，放在文章里好像有点拉胯，所以准备重新绘制。前期过程在专题（3）中已经介绍过了，这里只有后期优化。WGCNA...
