1.加载数据 2.执行默认的差异表达测试 Seurat 的大部分差异表达特征可以通过“FindMarkers()”函数访问。 默认情况下，Seurat 基于非参数 Wilco...
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单细胞测序之差异表达基因获得方法
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RNA-seq(7): DEseq2筛选差异表达基因并注释(bioMart)============================================写在前面：可以参考另外一篇《得到差异基因后怎么做？[https://www.jians...
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（RNA-seq工具比较）edgeR、limma、DESeq2三种差异表达包比较文章目录 加载R包和输入数据 表达数据整理3.edgeR包做差异表达4.limma包做差异表达5.DESeq2包做差异表达6.比较三种包差异表达基因筛选结果 1. 加载R包和...
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使用edgeR进行无重复差异表达分析写这篇文章一部分原因是填2年前的一个坑 转录组入门（7）：差异表达分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波无重复的差异表达分析, 所以专门去学了edgeR 我个人是不太推荐...
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【客户文献解读】基于iTRAQ定量蛋白质组学揭示了沙雷氏菌CM01的蛋白质组学变化及Cr(Ⅵ)抗性机制
本期解读 iTRAQ-based quantitative proteomic reveals proteomic changes in Serratia sp. CM01 ...
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scRNA-Seq | SCENIC 推断基因调控网络和细胞类型转录因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因组，与特定DNA序列结合 (TFBS/motif) ，调控DNA转录过程的一类蛋白质。转录...
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【R画图学习22.1】进化树和气泡组合图今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中，可以看出，图片分成2个部分，左边是进化树，右边是类似气泡图。 下面我们用一组简单的文件进行测试： 进化树文件： (((A...
