你好关于缺失:bcftools view -i "F_MISSING <= 0.2" 相当于vcftools的max-missing 0.8,这里-i F_MISSING <= 0.2表示保留缺失率小于0.2的变异,是不是应该是相当于vcftools的max-missing 0.2(最大缺失率0.2)
bcftools的常用命令tabix index 提取指定染色体 BCFTOOLS 设置 统计有多少个SNP: 过滤 F_MISSING MAF F_MISSING 加 MAF 注意 过滤不变位点: ...
tabix index 提取指定染色体 BCFTOOLS 设置 统计有多少个SNP: 过滤 F_MISSING MAF F_MISSING 加 MAF 注意 过滤不变位点: ...