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欢迎大家关注我的公众号：一只勤奋的科研喵[http://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__biz=Mzg2MjU2NDQwMg==&hid=2&s...

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突变文件 突变类型很多 83_prime_UTR_variant58885_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant2725_...

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得到每组对应的某一年的生存率值 我们知道log-rank比较的是整体的生存率，那当我们需要比较某个时间节点的生存率时候（比如某个基因阴性阳性两组的2年生存率）先用spss或者...

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一.基因突变的基础知识 二.SNP突变分析 （等更新）

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一.对于芯片数据： GEO中的Series Matrix File(s)通常是经过了标准化和对数转换的数据，但是不是所有的都是 具体判断方法： 表达量是否需要重新标准化： 可...

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加载所需R包 构建测试数据集 使用Heatmap函数绘制热图 使用HeatmapAnnotation函数构建注释对象 使用add_heatmap函数组合多个热图或注释信息 r...

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用david转换成ENTREZID基因 对KEGG富集结果可视化 画出来选定某一通路的图形 画出来选定某一通路的图形，我们的基因集中在该通路出现的基因变成绿色显示在该通路中

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书接第二回TCGA-2.GDC数据整理，留下了一个大坑，GDC下载的数据整理出来表达矩阵是缺少行名的。 手痒的我要动手了。 加行名并不容易，我捣鼓了好久啊。 思路 1.表达矩...

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近日，因宿舍小赵同学看文章，看到一张关于相关性分析结果可视化的图表，并对其表达含义表示了百思不得其解，于是在我们的男神428宿舍引发了一波生信小热潮。可能对于大佬们来说这是很...

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一从TCGA下载突变信息 这里下载的是maf文件 二把样本根据是否突变分为野生型和突变型 可以看到包含了突变基因和对应的样本 最后 感谢jimmy的生信技能树团队！ 感谢导师...