Y大宽

CytoHubba:发现复杂网络的关键目标和子网络网络对呈现包括PPI，基因调控，细胞路径和信号转导等多种类型生物数据非常有用。我们//+重要性，并且这也能帮助我们发现网络中...

lilylotus4499

转载自Cytoscape NetworkAnalyzer Online Help https://med.bioinf.mpi-inf.mpg.de/netanalyzer/...

余绕

超几何分布检验常用来对venn图两个圈overlap的显著性进行检验设总共有29个人，其中11个吸烟者，18个非吸烟者，现从中随机抽取16个样本（在此实验中对应着肺癌病人），...

没有猫但是有猫饼

参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...

米开朗巨魔

将Cox回归分析的结果提取出来，用森林图展示 step1 生成示例数据 生成的df数据框，如下图所示： 包含了病人ID，生存时间，结局事件和50个基因的表达数据。因为都是...

墨墨如

随着公共数据库的建立和开放，越来越多的研究者可以接触到测序数据，非常适合想我们这种“三无”研究者（无课题，无经费，无文章）运用公共数据找点事情干，可以是另辟蹊径从某个独特的视...

卡布达b1

前言：在构建ceRNA 网络时，需要计算lncRNA 与 蛋白编码gene (pc gene） 间的表达相关性，一般采用皮尔逊相关系数。具体如何做呢？ 首先获得lncRNA...

taoyan

TaoYan 计算相关矩阵 R内置函数cor()可以用来计算相关系数：cor(x, method = c("pearson", "kendall", "spearman"))...