上一篇我们讲了传统venn图的画法，今天测试另外一个包VennDetail，有点还是它综合了upset，从而能处理大于5维的数据。 首先没有安装的话，安装这个包。 libra...
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【R画图学习6.2】Venn图---VennDetail -
cel格式的芯片原始数据处理
收到一个学生求助，得到空的表达矩阵，限于目前初学的状态，处理原始数据比较困难，但又急用，这不，我来帮忙咯。 1.初步探索 表达矩阵确实是空的，不过附件里提供了cel格式的原始...
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使用R下载HPA数据库的免疫组化数据
HPA数据库有丰富的切片数据和免疫组化的切片，可以从网站一个个下载保存，然后把对应的信息保存，再重命名，再次比对信息。 但是，这样的操作，可谓耗时耗力，还有可能在对比的时候出...
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数据分析：RT-qPCR分析介绍 做完转录组分析之后，一般都要求做qRT-PCR来验证二代测序得到的转录本表达是否可靠。荧光定量PCR是一种相对表达定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析...
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TCGA的ID转换可以一步到位了
0.背景知识 TCGA或TCGA+GTEx的表达矩阵，行名都是ensamble id，因为TCGA数据的参考基因组版本是genecode V22，xena重新分析的TCGA+...
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TCGA学习03：生存分析TCGA学习01：数据下载与整理 - 简书 [https://www.jianshu.com/p/79816a20cbb1]TCGA学习02：差异分析 - 简书 [htt...
