GEO数据挖掘或转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时,结果中...
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GEO数据挖掘或转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时,结果中...
随着测序技术的发展,每年测序数据量以PB级增长。随着海量测序数据的增长,越来越多的研究人员开始挖掘公共数据库中的测序数据的意义。已有很多研究表明,某个基因可能参与了某种肿瘤的...
Differential gene expression analysis:差异表达基因分析 Differentially expressed gene (DEG):差异表达...
简写 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千个碱基的转录每百万映射读取的rea...
细胞类型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
TIDE(http://tide.dfci.harvard.edu/[http://tide.dfci.harvard.edu/])代表肿瘤免疫功能障碍和排斥,用于评估免疫疗...
测序技术的飞速发展积累了大量转录组数据,从中也发现了很多新的转录本。区分这些转录本是蛋白编码序列还是非编码序列是基因组注释和新基因鉴定中的重要研究内容。但对于大量存在的无训练...
方法一 ID转换,ENTREZID是进行GO分析最好的ID类型(针对clusterProfiler)ID转换用到的是bitr()函数,但我的SYMBOL 转 ENTREZID...