本文首发于“生信大碗”公众号，转载请注明出处 之前我们讲了测序以及第一代测序技术，还没看的小伙伴可以先去补补课（你真的搞懂测序技术了吗——测序、第一代测序[https://w...
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你真的搞懂测序技术了吗——第二代测序 -
多个10x单细胞对象的合并和批次校正--seurat锚点整合+Harmony练习数据集的GEO编号：GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
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snakemake使用笔记
snakemake是一个用来编写任务流程的工具，用python编写的，因此其执行的流程脚本也比较通俗易懂，易于理解。 一、从一个简单的例子开始 1、安装snakemake 安...
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samtools flagstat 统计结果的理解
比对结束后，需要了解比对结果的情况，可以采用samtools flagstat进行统计samtools flagstat统计bam文件比对后每一个参数的解释如下： 如果有些结...
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Mac Vs Code Python环境搭建一、先决条件 安装Python插件。 安装Python 3的一个版本，有几种途径： Linux上的内置Python安装。 MacOS上使用brew安装。brew instal...
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R语言GEO数据挖掘01-数据下载及提取表达矩阵
作者：白介素2 这一节的内容包括应用 GEOquery包下载芯片数据，提取表达矩阵，提取metadata信息。解决一个探针对应多个基因的问题 GEO数据下载-GEOquery...
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R语言练习：基于两组基因差异，循环绘制箱线图组合这里分析小练习来自生信星球（一个很好的生信学习平台），有蛮多值得学习的知识点，一起来学习吧~ 假设数据：两组实验对象，各三个重复样本。进行转录组分析之类的之后，结果得到10个...
