欢迎关注同名公主号：BBio 流程包括单切片的基本分析、scRNA整合、多切片整合。 参考：https://satijalab.org/seurat/articles/spa...
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分析流程||Seurat空间转录组分析流程 -
单细胞空间转录分析之Seurat将空间位置信息和转录组分析相结合，对于癌症、免疫、肿瘤免疫相互作用，组织微环境，神经和发育等领域，有着令人期待的应用前景。 而作为单细胞转录组必备R包Seurat,与时俱进，...
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10X空间转录组-----空间高变基因检测之SpatialDE今天我们来学习一下简单的基础知识，空间高变基因，之前呢，已经分享过Seurat内置的方法计算高变基因，文章在10X空间转录组之基因的空间表达模式[https://www.ji...
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clusterProfiler: No gene can be mapped | 怎么破？日常瞎掰 奇奇怪怪的事又发生了，真就应了那句话，不出意外的话，意外就会发生了。。。 最近需要用clusterProfiler做KEGG富集，然后就出现了意外，居然出现N...
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TCGA数据库MAF文件的分析以及可视化（maftools包的使用）这两天“王院长”帮别人分析snv数据，顺便给我推荐了一个R包：maftools。我看了一下官网，感觉是个非常强大的R包。那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了，但都是用...
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2023-05-06 | vep注释的解析注意： non-coding包括intergenic + UTR + intronexon包括CDS + UTRupstream和downstream一般指基因上下游的2kb...
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使用mclust进行聚类分析mclust(Model-based clustering) 能够基于高斯有限混合模型进行聚类，分类以及密度估计(density estimation)。对于具有各种协方差结...
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WGCNA原理和分析流程WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis，即加权基因共表达网络分析。它是一种分析多个样本基因表达模式的分析方法，...
