斯希笔记

1.利用箱线图比较两类样本的某个细胞比例差异 比较直观，但是缺点在于如果单细胞样本个数过少且异质性大，导致很难有统计学显著意义 2.R o/e 比值 好多文章都有用这个，我的...

单细胞空间交响乐

Seurat4已经出了beta版本，最大的改变有两点（1）推出了多模态分析，WNN（权重最近邻），由此可以联合单细胞转录组与蛋白组、ATAC，空间转录组等一起分析（2）Rap...

谢京合_AI机器学习

seurat涉及的数据分析包括很多步骤。之前只顾着干活儿，也没有系统的整理过分析中的具体内容。这里就参照网上大神们分享的帖子，来梳理一下。 1、读入数据。 这个函数就是根据输...

单细胞空间交响乐

今天我们来分享一下一款新的细胞通讯分析软件----RNAMagnet我们来详细了解一下这个软件的功能： 安装： 我们来逐步分析一下这个软件： 第一步：获取包内的配受体对 这个...

whitebird

现在回想单细胞项目的一些常规分析，clusters/groups间的差异表达分析（differential expression analysis）几乎是分析必备项，Find...

backup备份

GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis，中文翻译就是基因集富集分析，最早提出GSEA的文章是下面的这篇文献： 基因集富集分析是...