hello,大家好,今天我们来继续分享关于10X空间转录组的分析内容,今天的内容重点是分区,当然了,空间的分区往往是人为划分的,但是我们要寻找到一种计算的方法,利用数学的手段...
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参考教程:https://www.biostars.org/p/285296/[https://www.biostars.org/p/285296/]整体思路可分为两大步:(...
参考: 第六章 scRNA-seq数据分析 使用monocle包进行pseudotime分析 monocle2 官方教程 单细胞转录组学习笔记-18-scRNA包学习Mono...
刘小泽写于2018.8.27-28我们日常使用R一般不会使用它的编程工作(即写R包的任务),许许多多的的生信函数、统计软件也都是现成的,我们要做的最繁琐、最耗时的工作就是对数...
在GEO读取矩阵文件,或者其他文件的时候常常会碰到下面这样的情况 这样对后面的ID转化非常不方便,所以我们要去掉双引号代码如下 但是要注意的是,我们是一整个矩阵,有几千行,不...
报错如下 1. 如果你是运行如下代码报的错。 则添加一行代码即可,如下 2. 如果不是,看下面 2.1问 Sorry for disturbance.My question ...
在之前的文章里,我主要讲了如下两个内容:(1) 认识Cell Hashing;(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵。相信大家已经知道了cell hashing与普...
刘小泽写于2020.6.30 + 7.2为何取名叫“交响乐”?因为单细胞分析就像一个大乐团,需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExper...
导读 人体似乎能够产生无限量的抗体(免疫球蛋白[Ig])分子-也许宇宙中的每个抗原至少有一个!计算表明,人类抗体库中可能有多达10^11种不同的抗体分子可用,这些抗体具有不同...