hello，大家好，今天我们来继续分享关于10X空间转录组的分析内容，今天的内容重点是分区，当然了，空间的分区往往是人为划分的，但是我们要寻找到一种计算的方法，利用数学的手段...
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10X空间转录组 & 蛋白组联合分析之空间分区模式 -
igraph包可视化基因调控网络参考教程：https://www.biostars.org/p/285296/[https://www.biostars.org/p/285296/]整体思路可分为两大步：（...
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Monocle2 学习笔记参考： 第六章 scRNA-seq数据分析 使用monocle包进行pseudotime分析 monocle2 官方教程 单细胞转录组学习笔记-18-scRNA包学习Mono...
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R语言批量去掉“双引号”在GEO读取矩阵文件，或者其他文件的时候常常会碰到下面这样的情况 这样对后面的ID转化非常不方便，所以我们要去掉双引号代码如下 但是要注意的是，我们是一整个矩阵，有几千行，不...
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Provided graph.name not present in Seurat object
报错如下 1. 如果你是运行如下代码报的错。 则添加一行代码即可，如下 2. 如果不是，看下面 2.1问 Sorry for disturbance.My question ...
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单细胞分析实录(3): Cell Hashing数据拆分在之前的文章里，我主要讲了如下两个内容：(1) 认识Cell Hashing；(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵。相信大家已经知道了cell hashing与普...
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单细胞交响乐7-聚类分群刘小泽写于2020.6.30 + 7.2为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExper...
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第6章：抗体多样性2021-04-17导读 人体似乎能够产生无限量的抗体(免疫球蛋白[Ig])分子-也许宇宙中的每个抗原至少有一个！计算表明，人类抗体库中可能有多达10^11种不同的抗体分子可用，这些抗体具有不同...
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鸢尾花(iris)数据集分析Iris 鸢尾花数据集是一个经典数据集，在统计学习和机器学习领域都经常被用作示例。数据集内包含 3 类共 150 条记录，每类各 50 个数据，每条记录都有 4 项特征：...
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R---plot()参数详解plot是R中的基本画图工具，直接plot(x)，x为一个数据集，就能画出图。细节往往制胜的关键，所以就详细来看下plot的所有可设置参数及参数设置方法。 下面讲到的图形参数...
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如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清晰地展现出来，不少读者朋友应该...
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通过Linux命令行使用Aspera全速上传测序数据到NCBI数据库每试错一次，就离本质就更近一步。----小蓝哥 为什么要上传数据 师姐找我帮忙上传宏基因组数据到NCBI，大概是45G。NCBI提供了很多种可供选择的上传方式： 没有海外节点...
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进化树在线制作工具iTOL教程（2）：添加文本添加文本 利用iTOL，我将进化树分为三个群体，接下来就是添加文本 与evolview一样，添加文本需要datasets，依然可以去参考help页面 这里我放上了官网中所有参...
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Pacbio和Nanopore测序技术之拳王争霸
作者:May审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 大家好，又到了阿拉丁聊基因组的时间了。今天我们按照上期的计划，我们来聊一下基因组测序技术中的两大神兵利器之--Pacbio...
