25. 曼哈顿图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用qqman包绘制曼哈顿图 使用CMplot包绘制曼哈顿图
IP属地：天津
-
-
LD衰减图的理解与应用
在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的基础。如何正确理解并且进行相关的LD连锁不平衡分析是群体遗传中很基本的一件事情。下面和大家一起学习一下...
-
GWAS基本分析内容之前给大家大致介绍了GWAS在临床生信分析中的概况，包括一些基本概念，原理和注意事项（出门左手边—>临床生物信息学中的GWAS分析），这次具体讲讲GWAS基本分析内容及结果解...
-
全基因组关联分析（GWAS）-基本分析内容1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1）按分型百分比条件过滤，多数文章剔除缺失率在20%以上的位点，样本量较大的群体中，可以将缺失率小于50%的位点都保留；• ...
-
【GWAS】GAPIT使用教程
GAPIT（genome association and prediction integrated tool）华盛顿大学等于 2012 年开发的软件（软件主页：http:/...
-
vcftools安装及基础用法
vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具，功能非常强大，而且运算速度也很快。 1.下载及安装 1.1 下载地址 http://vcftool...
-
GWAS分析- P值计算过程 (七)目前针对GWAS分析有很多软件，比如Plink、 Tassel、Gapit、EMMAX、gemma和GCTA等等,这些软件通过输入基因型文件和表型文件，可以直接求出每个标记对...
-
GWAS分析-多个性状的manhattan组合图绘制(五)在之前GWAS分析中，我们已经学会了如何使用R包qqman对单个性状绘制manhattan图，有时会需要将多个性状的manhattan图组合到一张图中分析，今天就带小伙伴学习...
-
GWAS分析-R包GAPIT (四)GAPIT (Genome Associated Prediction Integrated Tool),是一个R包，使用Gapit可以进行全基因组关联分析和基因组预测（选择...
