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    VCF格式

    刘小泽写于18.7.17所有的数据,一旦要找变异位点信息,就离不开VCF。豆豆也是在写一个重测序的操作流程,遇到了VCF文本,之前也是没有了解过,这次再多学一个格式官方最新说...

  • GATK4 多个样本GenotypeGVCFs前用 CombineGVCFs还是GenomicsDBImport

    我们知道,GATK 4 多个样本joint genotyping用模块GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三种形式的输入文件:1)a sin...

  • NGS数据下载

    本来想重复冷泉港Lippman 2017年在Cell上的一篇文章:Bypassing Negative Epistasis on Yield in Tomato Impose...

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    3. SNP Calling

    以GATK流程为例,简单来说,SNP Calling主要包括以下几步: 1. 给参考基因组建立索引:samtools faidx、bwa index, gatk Create...

  • 如何成为有效学习的高手

    最近在得到听了这篇文章,感觉比较有用,会随听随更新。 Day 1:高效学习的定义。 高效学习,即找到最适合自己的学习手法,在相对短的时间内集中注意力,以解决一个工作和生活当中...

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    2. BSA的原理

    BSA(Bulked Segregant Analysis),集群分离分析或分离群体分组分析法。两个特点:1. 混池2. 性状分离所以,BSA可以称之为分析有性状分离的群体分...

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    1. 热身(案例及实验设计)

    什么是BSA-seq BSA(Bulked Sergeant Analysis),即分离体分组混合分析法,也称为集群分离分析法或混合分组分析法,是从近等基因系分析法演变而来的...

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