发简信
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NGS数据下载
本来想重复冷泉港Lippman 2017年在Cell上的一篇文章：Bypassing Negative Epistasis on Yield i...
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3. SNP Calling以GATK流程为例，简单来说，SNP Calling主要包括以下几步： 1. 给参考基因组建立索引：samtools faidx、bwa ind...
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如何成为有效学习的高手
最近在得到听了这篇文章，感觉比较有用，会随听随更新。 Day 1：高效学习的定义。 高效学习，即找到最适合自己的学习手法，在相对短的时间内集中注...
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2. BSA的原理BSA（Bulked Segregant Analysis），集群分离分析或分离群体分组分析法。两个特点：1. 混池2. 性状分离所以，BSA可...
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1. 热身（案例及实验设计）什么是BSA-seq BSA（Bulked Sergeant Analysis），即分离体分组混合分析法，也称为集群分离分析法或混合分组分析法，...
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bash下的特殊变量及含义
特殊变量列表 $0：当前脚本的文件名$n：传递给脚本或函数的参数。n 是一个数字，表示第几个参数。例如，第一个参数是$1，第二个参数是$2。$#...
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Let's awk!
awk是Linux自带的一种文本处理工具，能够快速有效地对Linux下的文本文件进行处理，尤其针对较大的文本文件。在处理生信文本文件时，相较于P...
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Lecture 11-20
本地blast使用 下载及安装： 使用：blast与大多数序列比对软件一样，需要对参考序列创建一个哈希结构的数据库： 序列比对 blast可以对...
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Lecture 1-10最近这周帮助组内成员完成一些高重复性基本湿实验、下地收集果实，以及自己的一小部分分子生物学实验外，花了些时间进行了Biostar Handboo...